Panel VAR modelinde birimler arası korelasyonun bulunduğu durumda ikinci kuşak Panel VAR modelleri kullanılmaktadır. Eğim parametrelerinin davranışına göre modeller homojen ve heterojen olarak ele alınabilmektedir (Yerdelen Tatoğlu, 2026, s. 157).

Homojen eğim parametreleri durumunda birimler arası korelasyonun etkisini azaltmak amacıyla modele yatay kesit ortalamalarından fark alma (time-demeaning) dönüşümü uygulanabilmektedir.

Eğim parametrelerinin heterojen ve birimler arası korelasyonun bulunduğu durumda ise birim boyutu küçükse SUR tipi yöntemler; birim boyutu büyükse Ortak Korelasyonlu Etkiler (CCE) veya Genişletilmiş Ortalama Grup (AMG) gibi yöntemler kullanılabilmektedir. Heterojen dinamik yapı nedeniyle etki-tepki fonksiyonları ve varyans ayrıştırmasının panel geneli için yorumlanması güçleşebilmektedir (Yerdelen Tatoğlu, 2026, s. 160).